Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skap2Q3UND0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms