Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ankrd27Q3UMR0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms