Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms