Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc61Q3UJV1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms