Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp19Q3UJD6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms