Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms