Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms