Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zyg11bQ3UFS0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms