Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Parp8Q3UD82 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms