Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gse1Q3U3C9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gse1Q3U3C9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms