Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms