Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem35bQ3U0Y2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem35bQ3U0Y2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem35bQ3U0Y2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms