Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
InipQ3TXT3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
InipQ3TXT3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms