Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TTL0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TTL0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TTL0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3TTL0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTL0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTL0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTL0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3TTL0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms