Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms