Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trappc10Q3TLI0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc10Q3TLI0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms