Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Smarca4Q3TKT4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Smarca4Q3TKT4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarca4Q3TKT4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms