Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc13Q3TIR1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms