Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

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Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stt3bQ3TDQ1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stt3bQ3TDQ1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms