Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms