Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prr27Q3SYJ2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prr27Q3SYJ2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms