Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms