Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
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Shroom4Q1W617 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
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