Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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ptchd1Q14B62 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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ptchd1Q14B62 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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ptchd1Q14B62 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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ptchd1Q14B62 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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ptchd1Q14B62 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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ptchd1Q14B62 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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ptchd1Q14B62 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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ptchd1Q14B62 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ptchd1Q14B62 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ptchd1Q14B62 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ptchd1Q14B62 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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ptchd1Q14B62 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms