Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms