Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Ttc39dQ0VF76 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Ttc39dQ0VF76 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Ttc39dQ0VF76 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Ttc39dQ0VF76 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Ttc39dQ0VF76 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Ttc39dQ0VF76 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Ttc39dQ0VF76 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Ttc39dQ0VF76 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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Ttc39dQ0VF76 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Ttc39dQ0VF76 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Ttc39dQ0VF76 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Ttc39dQ0VF76 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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