Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lrriq1Q0P5X1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms