Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TrioQ0KL02 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms