Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms