Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms