Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700061G19RikQ08EE8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms