Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ebf1Q07802 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ebf1Q07802 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms