Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col9a2Q07643 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms