Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp2Q06649 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp2Q06649 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms