Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms