Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd1Q04519 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 555.5 ms