Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RelaQ04207 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms