Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms