Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms