Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nucb1Q02819 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms