Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms