Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms