Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms