Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Top2aQ01320 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms