Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin2cQ01098 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms