Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8a1Q00558 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms