Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfdP97946 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfdP97946 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfdP97946 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfdP97946 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VegfdP97946 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VegfdP97946 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VegfdP97946 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfdP97946 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfdP97946 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms