Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
rp9P97762 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
rp9P97762 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
rp9P97762 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
rp9P97762 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
rp9P97762 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
rp9P97762 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
rp9P97762 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
rp9P97762 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
rp9P97762 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
rp9P97762 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
rp9P97762 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
rp9P97762 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
rp9P97762 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
rp9P97762 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
rp9P97762 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
rp9P97762 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
rp9P97762 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
rp9P97762 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
rp9P97762 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
rp9P97762 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
rp9P97762 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
rp9P97762 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
rp9P97762 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
rp9P97762 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
rp9P97762 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
rp9P97762 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
rp9P97762 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
rp9P97762 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
rp9P97762 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
rp9P97762 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
rp9P97762 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
rp9P97762 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
rp9P97762 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
rp9P97762 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
rp9P97762 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
rp9P97762 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
rp9P97762 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
rp9P97762 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
rp9P97762 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
rp9P97762 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
rp9P97762 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
rp9P97762 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
rp9P97762 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
rp9P97762 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
rp9P97762 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
rp9P97762 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
rp9P97762 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
rp9P97762 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
rp9P97762 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
rp9P97762 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
rp9P97762 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
rp9P97762 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms