Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmklr1P97468 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms