Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bop1P97452 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms